Spanoulis revient après une saison avec Houston en NBA.
Spanoulis est champion d’Europe en titre avec l’équipe nationale grecque, avec qui il a aussi gagné une médaille d’argent aux derniers Championnats du Monde.
Spanoulis a signé un contrat de trois ans. Il a eu un vrai impact lors de sa seule et unique saison d’Euroligue, en 2005-06, il affiche en moyenne 14.5 points et 3.1 passes avec 61.7 % de réussite à deux points, aidant Panathinaikos à atteindre le dernier match avant le Final Four.
Spanoulis a été transféré de Houston à San Antonio pendant l’intersaison, mais il a décidé de revenir en Europe.